一、代理納稅審查的基本內容
1.審查其核算是否符合《企業財務通則》和分行業財務制度及會計制度。
2.審查計稅是否符合稅收法規，重點是審查計稅依據和稅率。
3.審查納稅人有無不按納稅程式辦事，違反徵管制度的情況。
二、會計報表的審查
審查會計報表是納稅審查的重要環節，在通常情況下，納稅審查是從審查和分析會計報表開始的，以瞭解納稅人經濟活動的全部情況，同時，通過對各種報表的相關指標及相互關係的審查分析，可發現存在的問題，進一步確定審查的重點。
(一)資產負債表的審查
1.對流動資產各專案的審查與分析
若流動資產實際佔用數增長過快，則應注意是因材料或商品集中到貨或因價格變動等因素引起，還是由於管理不善、物資積壓、產品滯銷或者是虛增庫存成本所造成，以便進一步分析企業有無弄虛作假、亂擠成本等問題。
2.對長期投資、固定資產、無形及遞延資產的審查與分析
固定資產的審查分析，首先是瞭解資產增減變動的情況，其次，在核實固定資產原值的`基礎上，應進一步核實固定資產折舊額，審查企業折舊計算方法是否得當，計算結果是否正確。
對"在建工程"專案的稽核，應注意瞭解企業有無工程預算，各項在建工程費用支出是否核算真實，有無工程支出與生產經營支出混淆情況等。
注意企業有無將不屬於開辦費支出的由投資者負擔的費用和為取得各項固定資產、無形資產所發生的支出，以及籌建期間應當計入資產價值的匯兌損益、利息支出等記入"遞延資產"賬戶(提示：按照新會計準則應為"長期待攤費用"賬戶)的情況，並稽核固定資產修理費支出和租入固定資產的改良支出核算是否準確，攤銷期限的確定是否合理，各期攤銷額計算是否正確。
(二)損益表
1.銷售收入的審查
如果銷售數量下降，應注意企業有無銷售產品不通過"產品(商品)銷售收入"賬戶(提示：按照新會計準則應為"主營業務收入"賬戶)核算的情況或企業領用本企業產品而不計銷售收入的情況。
2.銷售成本的審查
3.營業稅金及附加的審查
由於銷售收入與營業稅金有密切的聯絡，兩者成正比例地增減。
4.銷售利潤的審查
5.營業利潤的審查
6.投資收益的審查分析
7.營業外收支專案的審查與分析
對於營業外收入，應注意企業有無將應列入銷售收入的款項或收益直接記作營業外收入，漏報流轉稅額。
(三)現金流量表的審查
應注意對現金流量表的有關專案數字來源及計算的正確性，即主要核對經營活動、投資活動和籌資活動產生的現金流量。
三、不同委託人代理審查的具體內容
(一)代理審查按流轉額徵稅稅種的主要內容
(二)代理審查按所得額徵稅稅種的主要內容
(三)代理審查按資源、財產、行為徵稅稅種的主要內容
四、會計賬簿的審查與分析
(一)序時賬的審查與分析
(二)的審查與分析
企業查賬的重點應放在明細賬簿的審查上。
(三)明細分類賬的審查與分析
1.分析總分類賬和明細分類賬記錄是否吻合。
2.審查明細賬的業務摘要，瞭解每筆經濟業務是否真實合法，若發現疑點應進一步審查會計憑證，核實問題。
3.審查各賬戶年初餘額是否同上年年末餘額相銜接。
4.審查賬戶的餘額是否正常，計算是否正確，如果出現反常餘額或紅字餘額，應注意核實是核算錯誤還是弄虛作假所造成的。
5.審查實物明細賬的計量、計價是否正確，有無將不應計入實物成本的費用擠入實物成本的現象，發出實物時，有無隨意變更計價方法的情況。
五、會計憑證的審查與分析
(一)原始憑證的審查
2.審查有無技術性或人為性的錯誤。注意資本性支出與收益性支出等，有無因此而影響當期或後期計稅所得額的情況。
3.審查有無白條入賬的情況。要注意有無白條作支出憑證的情況。
(二)記賬憑證的審查
1.審查所附原始憑證有無短缺，兩者的內容是否一致。
2.審查會計科目及其對應關係是否正確。
3.記賬憑證的會計科目與原始憑證反映的經濟業務內容是否相符。
