病因作用於機體使疾病發生以後，疾病便作為一個運動發展的過程不斷向前演變、推移，經過一定的時間或階段後，最終趨於結束，這便是發病學(Pathogenesis)所要研究的問題。
一、發病的基本原理
發病，是指疾病的發生過程。這是機體處於病邪的損害和正氣的抗損害之間的矛盾鬥爭過程。
中醫學認為，疾病的發生和變化，雖然錯綜複雜，但總其大要，不外乎關係到人體本身的正氣和邪氣兩個方面。
(一)正氣不足是疾病發生的內在依據
中醫發病學很重視人體的正氣，認為內臟功能正常，正氣旺盛，氣血充盈，衛外固密，病邪難於侵入，疾病無從發生，只有在人體正氣相對虛弱，抗邪無力的情況下，邪氣方能乘虛而入，導致疾病的發生。所以，正氣不足是發病的內在根據，在發病中佔主導作用。
(二)邪氣是疾病發生的重要條件
邪氣與發病的關係非常密切，主要體現在以下幾個方面：
1.邪氣影響發病的性質、型別與特點
不同類別、不同性質的邪氣作用於人體，可以發生不同的疾病，表現出不同的發病特點、病證性質或證候型別。
2.邪氣影響病情與病位
病情的輕重，除機體的正氣外，常與感邪的輕重以及邪氣的種類、性質有關。疾病的病位，亦與邪氣種類、性質及其致病作用相關。
3.某些情況下邪氣在發病中起主導作用
在某些特殊情況下(如高溫燒燙、高壓電流、毒蛇咬傷等)，即使正氣很盛，也難免被傷害。
(三)正邪鬥爭的勝負，決定發病與否
正邪相搏的勝負，決定著發病或不發病。若正氣旺盛，抗邪力強，則病邪難以侵入;即使侵入，正氣亦能驅邪外出，及時消除其不利影響，因而不致產生病理反映，即正勝邪負則不發病。反之，若正氣虛弱，衛外不固，則邪氣乘虛侵襲，使人體氣血陰陽失調，臟腑功能紊亂而發病，即邪勝正負則發病。
二、影響發病的因素
(一)氣候變化
四時氣候的異常變化，是孳生和傳播邪氣的條件，從而導致季節性的多發病。如春日多風，故多風病，易發風溫;夏令炎熱，溼熱蘊蒸，易致傷暑、中暑及溼熱病證;秋令易生燥邪，致發溫燥或涼燥;冬令嚴寒，易發寒病。當氣候發生急驟變化時，既易戕伐人體正氣，又是某些疫癘病邪孳生和傳播的條件，從而成為某些溫病、瘟疫的促發因素和流行的條件。
(二)地域特點
不同的地域，地勢高低、氣候特點、物產各有不同，且由於地殼元素分佈的'不均衡性，形成了不同的地域特點。這些因素可影響人們的生活習慣和生理特點，並導致地域性的多發病與常見病。如北方氣候寒冷，易生寒邪而致寒病;某些遠離海洋的山區，人群中易患地方性甲狀腺腫等。此外，有些人易地而居或旅行異地，初期常會發生“水土不服”。
(三)生活、工作條件
不良的生活、工作環境會成為致病因素或誘發因素，從而影響人的健康，引起疾病的發生。
(四)體質特點
1.體質因素決定對某些病邪的易感受性
不同的體質型別，對某些致病因素具有不同的易感性，因而易發的疾病亦不相同。如小兒臟腑嬌嫩，氣血未充，常易感受外邪或因飲食所傷而發病。
2.體質因素決定某些疾病的證候型別
體質與證候型別的關係，主要體現於兩個方面：
(1)感受相同的病因，因個體體質的差異，而表現為不同的證候型別。
(2)感受不同的病因，由於體質相同，可表現為相同或相似的證候型別。
(五)精神狀態
1.情志過激日久，可以成為致病因素。
2.疾病過程中亦可出現異常的情志變化。
3.導致情志變異有多種因素，如社會、自然環境、個體的氣質以及疾病本身等。
三、發病形式
由於個體的體質狀態不同，在發病形式上則表現出各種不同的型別。概括起來，發病型別主要有感而即發、伏而後發、徐發、繼發、復發等幾種。
(一)感而即發
感而即發，又稱為卒發、頓發。指感邪後立即發病。感邪而發多見於新感外邪、疫癘邪氣、情志驟變、中毒、急性外傷等情況。
(二)伏而後發
伏而後發是指感受邪氣後，病邪在其體內潛伏一段時間，或在誘因的作用下，過時而發。多見於外感疾病和某些外傷。
(三)徐發
徐發是指感邪後緩慢發病，又稱緩發。徐發與致病因素的種類、性質，以及體質因素等密切相關。
(四)繼發
繼發，是指在原發疾病的基礎上，繼而發生新的疾病。原發病與新產生的疾病在病理上密切相關。
(五)復發
復發是指原病再度發作或反覆發作。
復發的基本特點為：其一，是原有疾病的基本病理變化和主要病理特徵的重現;其二，原病加重，復發次數越多，病情越複雜;其三，與一定的誘因有關。
復發的誘因主要有重感致復、食復、勞復、藥復、情志致復以及自復。
