《財政部、國家稅務總局關於增值稅若干政策的通知》(財稅[2005]165號)規定：“一般納稅人登出時，其存貨不作進項稅額轉出處理，其留抵稅額也不予以退稅。”由於增值稅是價外稅，增值稅留抵稅額未納入企業會計損益核算，如果企業處於正常經營狀態，留抵稅額實際上具有一定的“資產”特徵，可以減少其納稅義務。但根據財稅[2005]165號檔案精神，企業清算時增值稅留抵稅額不能抵稅，只能將其轉入存貨的成本。
企業清算是處置資產、清償債務、投資者收回資本的過程，增值稅留抵稅額在資產負債表中“應交稅費”科目核算，屬於“應交稅費”的負數餘額。在企業登出過程中，增值稅留抵稅額處理主要注意以下幾個問題。
一是企業清算時存貨和已抵扣進項稅金的固定資產發生非正常損失。
企業清算時應先進行資產評估、清查，對存貨和已抵扣進項稅金的固定資產發生非正常損失的，應根據《增值稅暫行條例》第十條的規定，作進項稅額轉出處理，需補繳增值稅，調減增值稅留抵稅額。
二是企業清算時仍有存貨和已抵扣進項稅金的固定資產。
《財政部、國家稅務總局關於企業清算業務企業所得稅處理若干問題的通知》(財稅[2009]60號)規定，企業清算時，全部資產均應按可變現價值或交易價格，確認資產轉讓所得或損失。企業在向股東分配剩餘存貨和已抵扣進項稅金的固定資產前，需以銷售、抵頂債務方式處理存貨和已抵扣進項稅金的固定資產時，可以用增值稅銷項稅金抵減留抵稅額，留抵稅額抵頂完畢的，需繳納增值稅;留抵稅金未抵減完畢並將存貨和已抵扣進項稅金的.固定資產作為剩餘財產向股東分配的，其留抵稅金稅務機關不再退稅，鑑於留抵稅額屬於“應交稅費”的一項內容，應作為“負債清償損益”處理。應將其填入《企業清算所得稅申報表填報說明》(國稅函[2009]388號)附表二《負債清償損益明細表》第9行“應交稅費”中，並以此在清算申報表主表第二行“負債清償損益”中反映。
需要說明的是，儘管《企業清算所得稅申報表》包括“清算稅金及附加”專案，清算稅金及附加主要指清算環節發生的除企業所得稅和允許抵扣的增值稅以外的各項稅金及其附加，企業清算環節繳納的增值稅無法在本企業抵扣，不再將其作為價外稅，允許作為“清算稅金及附加”處理。
三是企業清算時沒有存貨和已抵扣進項稅金的固定資產，
直接將剩餘財產向股東分配，稅務機關對留抵稅金不再退稅，將其填入《企業清算所得稅申報表填報說明》(國稅函[2009]388號)附表二《負債清償損益明細表》第九行“應交稅費”。
綜上所述，企業在登出清算時，應考慮好留抵進項稅額的處理問題，否則可能出現少計“負債清償損益”，多繳清算企業所得稅的情況，或者被稅務部門追繳稅款、滯納金以及受到稅務行政處罰。
拓展：執行新準則委託貸款餘額怎麼處理
【問題】
我單位是一乘用車生產商，為用活自有資金並對經銷商資金支援，我們通過商業銀行向我們的特定經銷商提供委託貸款，並收取利息。一般貸款期限為6個月，截止8月份委託貸款餘額約20億。請問，在執行新準則後，這部份委託貸款餘額放在什麼科目?
【解答】
在《企業會計準則應用指南》(徵求意見稿)關於“持有至到期投資”科目核算說明中規定“企業委託銀行或其他金融機構向其他單位貸出的款項，也在‘持有至到期投資’科目核算。”而最終釋出的《企業會計準則應用指南》關於“持有至到期投資”科目核算說明中對此沒有進行規定，因此，目前很多企業誤認為將“委託貸款”放到“持有至到期投資”中進行核算。
《企業會計準則應用指南》關於“1303貸款”科目核算說明中規定“企業委託銀行或其他金融機構向其他單位貸出的款項，應將‘1303貸款’科目改為‘1303 委託貸款’科目。”這說明，企業的委託貸款應設定科目單獨進行核算，企業原委託貸款餘額轉入新的“1303 委託貸款”科目餘額。
