銀行轉賬結算是一個複雜的收付程式。每一筆款項的結算都涉及到付款單位、收款單位、付款銀行、收款銀行等幾個單位的多個環節的業務活動和資金增減變動。如果其中的任何單位和任何一個環節不按統一的規定辦理，都會給結算業務的進行帶來困難。因此為保證銀行結算的順利進行，付款單位、收款單位、付款銀行和收款銀行，應當嚴格遵循銀行結算的基本原則。這些基本原則包括：
(1)恪守信用，履約付款。在市場經濟條件下，存在著多種交易形式，相應地存在著各種形式的商業信用。收付雙方在經濟往來過程中，在相互信任的基礎上，根據雙方的資信情況自行協商約期付款。一旦交易雙方達成了協議，那麼交易的一方就應當根據事先的約定行事，及時提供貨物或勞務，而另一方則應按約定的時間、方式支付款項。
(2)誰的錢進誰的賬，由誰支配。銀行作為結算的中介機構，在辦理結算過程中，必須保護客戶資金的.所有權和自主支配權不受侵犯。各單位在銀行的存款，受法律保護;客戶委託銀行把錢轉給誰，銀行就把錢進誰的賬。銀行維護開戶單位存款的自主支配權，誰的錢就由誰來自主支配使用。除國家法律規定以外，銀行不代任何單位查詢、扣款，不得停止各單位存款的正常支付。
(3)銀行不墊款。銀行在辦理結算過程中，只提供結算服務，起中介作用，負責將款項從付款單位賬戶轉到收款單位賬戶，不給任何單位墊支款項。因為銀行給其他單位墊支款項，事實上已不屬於結算範圍，面屬於信貸範疇，會擴大信貸規模和貨幣投放。因此《支付結算辦法》規定銀行不墊款。付款單位在辦理結算過程中只能用自己的存款餘額支付其他單位款項，收款單位也只能在款項已經銀行辦妥收款手續，進入本單位賬戶後才能支配使用。
