扣除率是指稅務機關准予旅行社扣除專案金額佔旅遊業務銷售收入的比率，下面是小編蒐集整理的旅行社差額納稅增值稅發票開票注意事項，歡迎閱讀參考。
一、開票注意事項
旅行社選擇差額納稅時，需先填入扣除額，再填入價稅合計金額，調整稅率為6%，確認即可。值得注意的是，在列印的發票備註欄中應當顯示“差額徵稅”字樣，如果沒有這四個字，估計就是全額納稅了。
另外，開票人員填寫扣除額時，需要提前知道該業務的扣除額是多少，而對於絕大多數的旅遊產品來講，以前旅行社從未專門對這個資料考核過，所以，開票人員開票時很難開具發票。
建議，旅行社提前設定一個六項扣除費用的扣除率，便於開票人員開票。
在營業稅年代，海南地稅局對於核定徵收的小旅行社是按照70%核定五項扣除費用，河南地稅局是按照80%核定五項扣除費用，青島市地稅局按照70-85%核定五項扣除費用，而安徽淮北市地稅局則按照旅行社的旅遊收入總額依不低於0.75 %的負擔率徵收營業稅，等等，全國地稅局的標準不一。
因此，對於年銷售額在1000萬元左右的旅行社，其扣除率可以參考90%計算扣除額(經驗資料)。
營業稅年代，五項扣除費用是指旅行社替旅遊者支付給其他單位或者個人的住宿費、餐費、交通費、旅遊景點門票和支付給其他接團旅遊企業的旅遊費。
增值稅時代，六項扣除費用是指旅行社替旅遊服務購買方支付給其他單位或者個人的住宿費、餐飲費、交通費、簽證費、門票費和支付給其他接團旅遊企業的旅遊費用。
二、B2C、B2B模式開票注意事項
(一)B2C，是指組團社與遊客。
按照營改增36號文的規定，組團社收取遊客旅遊費用的，只能開具增值稅普通發票。值得注意的是，組團社收取某單位組織自己職工旅遊的旅遊費用時，是開具普票還是專票?按照36號文的規定，該出團單位的`費用應屬於職工集體福利，其專票的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣，因此，旅行社可為其全額開具普票。
(二)B2B，旅行社之間如何開具發票
按照36號文附件2 的規定，旅行社選擇差額納稅的，六項扣除費用只能開普票，而差額銷售額部分是開專票還是普票，值得注意。
按照36號文附件2對於旅行社的規定，旅行社“選擇上述辦法計算銷售額的試點納稅人，向旅遊服務購買方收取並支付的上述費用，不得開具增值稅專用發票，可以開具普通發票。”因此，就差額銷售額部分，組團社可以要求地接社開具專票，但另外一個規定，使得組團社取得的專票將變得沒有實質意義。
按照36號文附件2第一條(三)銷售額的規定：11.試點納稅人按照上述4-10款的規定從全部價款和價外費用中扣除的價款，應當取得符合法律、行政法規和國家稅務總局規定的有效憑證。否則，不得扣除。……。納稅人取得的上述憑證屬於增值稅扣稅憑證的，其進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。
組團社可以取得地接社的專票，但這個專票的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。這就意味著在旅行社B2B模式中，組團社在取得專票時將變得沒有任何實質意義。因此，建議地接社直接為組團社全額開具普票。
在B2B模式中，既包括組團社與地接社的交易，也包括組團社與同業旅行社的交易，還包括同業旅行社與地接社的交易。
值得注意的是，在營業稅年代，只有組團社才允許差額納稅，同業旅行社和地接社是全額納稅，而實際上，各種型別的旅行社都是選擇差額納稅。如果地稅機關依法要求全國的地接社和同業旅行社補稅的話，是由法律依據的。
這次營改增，財政部、稅總髮現這個不合理的規定，在36號文附件2中，將營業稅中的只允許組團社差額納稅，改為所有旅行社都可以差額納稅了。
以上觀點，僅供參考。
