在選擇會計軟體時，應注意軟體的合法性、安全性、正確性、可擴充性和滿足審計要求等方面的問題，以及軟體服務的便利，軟體的功能應滿足本單位當前的實際需要，並考慮到今後工作發展的要求。
(1)安全性。
安全性是指會計軟體提供的功能，能防止誤操作和作弊行為。例如：對於程式檔案和資料檔案，軟體應當有必要的加密或者其他保護措施，以防被非法篡改;軟體應當具有在計算機發生故障或者由於強行關機及其他原因引起記憶體和外存會計資料被破壞的情況下，利用現有資料儘量恢復到破壞前狀態的功能。
(2)合法性。
合法性是指會計軟體提供的功能，必須符合會計核算的規定。例如：軟體中採用的總分類會計科目名稱，編號方法，輸入的記賬憑證的格式等應符合國家統一的會計制度的規定;軟體應當同時提供國家統一會計制度允許使用的多種會計核算方法，以供使用者選擇;軟體應當提供機內記賬憑證列印輸出功能，可以提供原始憑證的列印輸出功能，必須提供會計賬簿、會計報表的列印輸出功能，列印輸出的格式和內容應當符合國家統一會計制度的規定。另外應當考慮版本的合法性。盜版軟體沒有可靠的技術保障和安全保障，還可能出現數據丟失現象，對會計核算工作的正常進行，會帶來難以找回的損失。並且得不到國家財政部門的認可。所以，使用者應取得合法的會計軟體，保障會計核算工作有條不紊地進行。
(3)正確性。
正確性是指計算正確和防止輸入錯誤。例如：當輸入的記賬憑證重號，輸入的記賬憑證金額借貸方不相等，軟體應提示或者拒絕執行;軟體應當提供自動進行銀行對賬的功能，根據機內銀行存款日記賬與輸入的銀行對賬單及適當的手工輔助，自動生成銀行存款餘額調節表;機內資料進行總分類賬、明細分類賬彙總的計算結果，應正確無誤;軟體應當提供機內會計資料按照規定的會計期間進行結賬的功能等。
(4)查詢性。
查詢性功能是指能查詢機內總分類會計科目的名稱、科目代號、年初餘額、期初餘額、累計發生額和餘額，能查詢記賬憑證。另外，設計複合條件查詢，模糊查詢，為使用會計資訊人員提供方便。靈活的介面切換功能，可以使會計資訊人員很靈活地尋找憑證、明細分類賬、總賬的資訊資料。
(5)易用性。
優美的的.軟體介面設計標準，美觀大方。業務流程設計清晰，賬簿報表一目瞭然。如果軟體的模組化程度高，在一個模組中聚合了多種功能，使會計人員只需記憶少量功能模組的使用方法就能完成全部工作，便於自學和掌握操作。
(6)擴充套件性。
遵循財務軟體資料交換標準，能否提供標準格式憑證、財政部通用報表介面、稅務介面、合併報表介面等標準資料介面，以滿足使用者對賬套資料的處理和二次開發需要。同時可將系統中的賬簿、報表、摘要、工資核算方法、憑證等從其他賬套引入引出，方便使用者互動資料，簡化使用者的工作。為行業系統內各單位、部門間不同產品版本的應用提供整合應用方案和能適應將來企業的發展要求。
(7)售後服務。
售後服務包括：會計軟體的日常維護、使用者培訓、二次開發、相關技術支援和軟體版本的升級換代。如果會計人員的計算機使用水平還不高，靠自身的能力，無法排除會計軟體執行中出現的全部故障，所以，還需要銷售單位派出人員加以解決。如果拖延，會計核算工作就會被迫停止。所以要了解培訓的內容、方式是否可行;維修服務人員是否充足;二次開發的方式是否具體;版本升級是否及時。
(8)價格。
會計軟體售價中，一般包括軟體價格、售後服務與培訓價格。銷售報價時，有時按軟體價格報價，有時按兩部分總計全額報價。
