D.1細粒棘球蚴
呈囊狀，內含液體，圓形或卵圓形多為單囊，直徑由不足1cm至10cm以上，巨大的蟲體可達30cm.組織學檢查可見囊壁分為兩層，外層為角皮層，內層為生髮層，生髮層向內長出許多原頭節或生髮囊。
肺包蟲患者在棘球蚴囊破裂後，可咳出含棘球蚴囊壁、子囊、原頭節和頂突鉤的痰液。肉眼即可識別棘球蚴囊壁和子囊，但仍應進行組織學檢查。痰液可直接塗片鏡檢。最好將痰液稀釋後離心，取沉渣鏡檢。肝包蟲病患者可應用B超引導下的細針穿刺檢查，或手術摘除棘球蚴後取材做檢查。
D.2多房棘球蚴
典型的多房棘球蚴是由無數直徑小於1mm至30mm的不規則的`棘球蚴囊組成泡狀結構。由於變性壞死，在病灶的中心區常形成充滿壞死組織的液化腔。顯微鏡檢查，可見較薄的PAS陽性的角皮層，生髮層常不易辨認。感染人體的多房球球蚴很少形成育囊和原頭節。泡球蚴的內部為壞死組織區，外部有組織細胞和淋巴細胞浸潤。泡球蚴周圍有慢性炎症反應、組織纖維化和鈣化。由於組織纖維化使泡球蚴變得緻密和堅硬。
