1、選購質量好的行動硬碟
大家不要貪圖便宜而選購過於廉價的行動硬碟，因為價格便宜的行動硬碟，是使用價格低廉的用料製作而成的，這樣的行動硬碟不僅執行不穩定，而且還容易帶來安全呢隱患。所以，建議使用者應該徐昂夠質量好，做工優秀的行動硬碟。
2、行動硬碟分割槽不要超過2個
如果行動硬碟分割槽超過2個，啟動行動硬碟時將會增加系統檢索和使用等待的時間。使用Full Speed USB2.0(以前稱USB1.1)傳輸介面的使用者，行動硬碟的分割槽更不應該超過兩個，否則將浪費掉許多寶貴的時間。
3、不要長期將行動硬碟插在電腦上
行動硬碟是用來臨時交換或儲存資料的，而不是一個本地硬碟。相比於內建硬碟會時刻都工作在惡劣的環境下，應該儘量縮短工作時間。如果有需要轉存下載資料的，正確的使用方法是使用本地硬碟下載和整理資料等，然後再將資料轉移到行動硬碟上,而不要在行動硬碟上完成。做工較好的行動硬碟盒也應該儘量按此操作，畢竟這樣可以更穩妥一些。
4、不要頻繁對行動硬碟整理磁碟碎片
對行動硬碟進行磁碟碎片整理會很容易損傷硬碟。如果確實需要整理，方法可採用將整個分割槽裡面的資料 都copy出來，再copy回去。
5、不要使用USB延長線
由於USB延長線的質量一般不太好，這會使USB資料同步出錯，使行動硬碟不能正常工作。如果機箱上的.前置USB介面無法保證正常使用，多半為供電問題，則應儘量把行動硬碟插在原主機板背板的USB介面上。
6、使用輔助供電線
行動硬碟盒最好自身帶有輔助供電線，好的行動硬碟盒會提供變壓器，一般的行動硬碟盒也有單獨的PS2或者USB 供電線，供電不足時一定要插上，即使USB介面供電足夠帶動硬碟，如果不是短時間工作，建議也插上，USB介面的供電總是比較勉強。
7、不要混用供電線
由於行動硬碟盒的供電線存在專用現象，供電線介面電壓可能會有所不同，亂插輕則燒盒子，嚴重則會燒燬硬碟。
8、細碎的檔案，應打包進行轉移
複製移動大的檔案肯定比細碎的小檔案有效率，太過細碎的小檔案建議可以打包後(壓縮方式採用“儲存”即可) 再進行復制移動。
9、要妥善保護行動硬碟
切忌摔打，輕拿輕放;注意溫度，不要過熱;乾燥防水，先退後拔。
