常見的嵌入式系統有Linux、uClinux、WinCE、PalmOS、Symbian、eCos、uCOS-II、VxWorks、pSOS、Nucleus、ThreadX 、Rtems 、QNX、INTEGRITY、OSE、C Executive。
除了WinCE的實時性稍差外，大多數嵌入式作業系統的實時性都很強，所以也可稱為實時作業系統Real Time Operating System.從事嵌入式的人至少須掌握一個嵌入式作業系統(當然掌握兩個更好)，這在嵌入式的所有技術中是最為關鍵的了。
目前最重要的RTOS主要包括：
第一類、傳統的經典RTOS：最主要的便是Vxworks作業系統，以及其Tornado開發平臺。Vxworks因出現稍早，實時性很強(據說可在1ms內響應外部事件請求)，並且核心可極微(據說最小可8K)，可靠性較高等，所以在北美，Vxworks佔據了嵌入式系統的多半疆山。特別是在通訊裝置等實時性要求較高的系統中，幾乎非Vxworks莫屬。Vxworks的很多概念和技術都和Linux很類似，主要是C語言開發。像Bell- alcatel、Lucent、華為等通訊企業在開發產品時，Vxworks用得很多。但Vxworks因價格很高，所以一些小公司或小產品中往往用不起。目前很多公司都在往嵌入式Linux轉(聽說華為目前正在這樣轉)。但無論如何，Vxworks在一段長時間內仍是不可動搖的。與Vxworks類似的`稍有名的實時作業系統還有pSOS、QNX、Nucleus等RTOS。
第二類、嵌入式Linux作業系統：Linux的前途除作為伺服器作業系統外，最成功的便是在嵌入式領域的應用，原因當然是免費、開源、支援軟體多、呼擁者眾，這樣嵌入式產品成本會低。Linux本身不是一個為嵌入式設計的作業系統，不是微核心的，並且實時性不強。目前應用在嵌入式領域的Linux系統主要有兩類：一類是專為嵌入式設計的已被裁減過的Linux系統，最常用的是uClinux(不帶MMU功能)，目前佔較大應用份額，可在ARM7上跑;另一類是跑在ARM9上的，一般是將Linux 2.4.18核心移植在其上，可使用更多的Linux功能(當然uClinux更可跑在ARM9上)。很多人預測，嵌入式Linux預計將佔嵌入式作業系統的50%以上份額，非常重要。缺點是熟悉Linux的人太少，開發難度稍大。目前很多教材和很多大學都以ucOS/II為教學用實時作業系統，這主要是由於ucOS/II較簡單，且開源，非常適合入門者學習實時作業系統原理，但ucOS/II的缺點是功能有限，實用用得較少，所以要學習就應學直接實用的，比如uClinux就很實用。況且熟悉了Linux開發，不僅在嵌入式領域有用，對開發Linux應用軟體，對加深作業系統的認識也有幫助，可謂一舉多得。據說，目前Intel、Philip都在大搞ARM+LINUX的嵌入式開發，Fujitum則是在自己的處理器上大搞Linux開發。目前在嵌入式Linux領域，以下幾個方面的人特別難找，一是能將Linux移植到某個新型號的開發版上;二是能寫Linux驅動程式的人;三是熟悉Linux核心裁減和優化的人。
第三類、 WindowsCE嵌入式作業系統：Microsoft也看準了嵌入式的巨大市場，WinCE出來只有幾年時間，但目前已佔據了很大市場份額，特別是在PDA、手機、顯示儀表等介面要求較高或者要求快速開發的場合，WinCE目前已很流行(據說有一家賣工控機的公司板子賣得太好，以至來不及為客戶裁減WinCE)。WinCE目前主要為4.2版()，開發平臺主要為WinCE Platform Builder，有時也用EVC環境開發一些較上層的應用，由於WinCE開發都是大家熟悉的VC++環境，所以學習Windows程式設計課程不會有多大難度，這也是WinCE容易被人們接受的原因，開發環境方便快速，微軟的強大技術支援，WinCE開發難度遠低於嵌入式Linux。對於急於完成，不想拿嵌入式Linux冒險的開發場合，WinCE是最合適了(找嵌入式Linux的人可沒那麼好找的)，畢竟公司不能像學生學習那樣試試看，保證開發成功更重要。根據不同的側重點 ，WinCE還有兩個特殊版本，一個是MS PocketPC作業系統專用於PDA上(掌上電腦)，另一個是MSSmartPhone作業系統用於智慧手機上(帶PDA功能的手機)，兩者也都屬於WinCE平臺。在PDA和手機市場上，除WinCE外，著名的PDA嵌入式作業系統還有Palm OS(因出現很早，很有名)、Symbian等，但在WinCE的強勁衝擊下，Palm和Symbian來日還能有多長?據觀察，目前在嵌入式平臺 上，LINUX是叫得最響，但還是WinCE實際用得更多。嵌入式LINUX可能更多地是一些有長遠產品計劃的公司，為降低成本而進行長遠考慮。 WinCE和多媒體(如MPEG技術)是微軟亞洲工程院目前做得較多的專案領域之一，他們很需要精通WinCE的人。
總結關於嵌入式作業系統類課程，若您覺得自己功底較深且能鑽研下去，則可去學嵌入式Linux;若您覺得自己VC++功底較好且想短平快地學嵌入式開發，則WinCE是最好的選擇。
