由於受現代醫學炎症概念的影響，清熱解毒一法每用於臨床各種疾病之中。由於此法的適應證多屬於西醫所說的傳染性疾病或感染性疾病的範圍，又由於此法所用的方劑和藥物在實驗中有明顯的`抑菌和殺菌效果，往往使人在臨證時，凡見傳染性疾病則不分在表、在裡，在髒、在腑，是風、是寒，是溼、是熱，即投清解毒法；凡見感染性疾病則不分初起與久病，膿成與未成，己潰與未潰，氣血之盛與衰，即投清熱解毒法，甚至把具有清熱解毒功能的中藥與方劑當作西藥抗生素使用。凡見西醫所說的炎症，即投清熱解毒之品。如此造成了此法的泛用、濫用的結果。其危害，輕者使病症遷延難愈，重者致寒涼傷中敗胃而貽害無窮。
清熱解毒法，如在辨證的前提下用之，則療效可靠，如離開中醫辨證而泛用，則流弊非淺。究其泛用原因，人多數是因為尚未牢固掌握中醫辨證的思維方法，因而容易受到西醫診病論治或實驗研究結論的干擾與影響。而一但離開了中醫辨證論治的思維方法，丟掉了中醫的特色，就難保證其臨床療效了，泛用濫用，其害無窮。可見做一名合格的中醫要切實練好辨證論治的基本功，不能通套西醫所謂“炎症”，而統施消炎，清熱解毒。
