國立大學在日本都是一流大學，由政府出資興辦，與眾多私立大學有本質區別。國立大學基於政府資金支援，攻讀碩士的費用比歐美國家便宜很多，也比讀語言學校便宜很多。日本國立大學都設有大學院(研究生院)，開設碩士、博士課程。日本國立大學大學院入學考試和麵試只在日本國內舉行，而且競爭激烈。由於簽證、語言等原因，中國學生很難赴日參加考試。 就讀日本國立大學大學院的學生持有留學簽證，這在申請獎學金、享受醫療保險、就業、交通費折扣等方面擁有更多的.機會和優惠。
赴日讀研的基本優勢如下：
1、日本教學質量尤其是大學教學質量世界一流。日本擁有世界一流大學且生活環境極好，培養了多名諾貝爾獎獲得者。
2、日本經濟發達，打工薪水高。同時又因為其勞動力嚴重短缺，於是成為了世界上最容易就業的國家之一。在就學期間，絕大部分學生可以實現學費、生活費自理，極大地減輕家庭負擔。
3、日本國、公立大學在入國管理局和大使館有很高的信譽，簽證申請一般來說都比較順利和簡單，成功率頗高。
4、日本國立大學學費便宜。平均只有30-40萬日元/年 (2.4萬-3.2萬人民幣/年)，接近國內研究生學費，並且還有獲得獎學金的機會。
5、直接申請日本大學院研究生，可以參考研究室的過去問題集，還能直接跟教授學習半年，在入學考試時會與很大的優勢。國立大學一般都設有面向留學生的免費語言課程，省去就讀語言學校的時間和金錢。
6、一流大學就業前景比較光明。赴日讀碩士將來無論回國或留日，都會有良好的就業前景。如在日本就業，一年即可收回全部教育投資。
隨著日本30萬留學生計劃的提出，2009年日本留學簽證出現了顯著上升的趨勢，日本留學成了更多學生及家長的首選。
