一 微生物在自然界中的分佈及微生物資源地開發
土壤中的微生物 ： 含量 細菌>放線菌>黴菌>酵母菌>藻類>原生動物
水體中的微生物： 淡水型 、海水型
空氣中的微生物 ：主要來自土壤，動植物和水體。
工農業產品中的微生物
極端環境下的微生物 嗜酸、嗜鹼、嗜熱、嗜冷、嗜鹽、嗜壓、抗輻射微生物。
生物體內外的正常菌群
二 微生物與生物環境的關係
互生：混菌培養
共生：如固氮菌與豆科植物間的共生，瘤胃微生物與反芻動物間的共生
寄生：如蛭弧菌與其宿主細菌間的`寄生
拮抗：如拮抗性放線菌能產生多種抗生素
三 微生物與自然界物質迴圈
碳素迴圈：主要通過光合作用和呼吸作用來實現。
氮素迴圈：生物固氮 硝化作用 同化性硝酸鹽還原作用 氨化作用 銨鹽同化作用 異化性硝酸鹽還原作用 反硝化作用 亞硝酸氨化作用。
硫素迴圈與細菌瀝濾：同化性硫酸鹽還原作用 脫硫作用 硫化作用 異化性硫酸鹽還原作用 異化性硫還原作用。
四 微生物與環境保護
1 微生物治理汙染；
2 沼氣發酵與環境保護；
3 用微生物檢測環境汙染。
第二部分 學習方法：對於本章的學習，首先應該結合資料認真學習課本知識，掌握全章的結構和內容，還要注意幾個重要的概念，如混菌培養，BOD，COD等等。再次，應該注意科學實驗，特別是藉助純培養來研究微生物的生長規律。最後，應注意實際應用。研究微生物的生態有很重要的實際意義，本章介紹了微生物生態的應用，如應用微生物治理汙染，進行環境檢測，沼氣發酵等等。
