長江中下游的黃梅天多半是從芒種節氣後期開始的。農民對芒種節氣的雨水很關心，故流傳下來的氣象諺語很多。如下：
◇芒種夏至是水節，如若無雨是旱天。（粵）
◇芒種夏至，水浸禾田。（粵）
◇芒種落雨，端午漲水。（湘）
◇芒種夏至常雨，颱風遲來；芒種夏至少雨，颱風早來。（閩）
◇芒種夏至天，走路要人牽。（蘇、皖、川、鄂、貴）（指陰雨天多，行路容易滑倒）
一般來說，在芒種節氣後期，從我國的長江流域到日本南部會出現雨期較長的連陰雨天氣，因正值梅子黃熟，故稱梅雨。古代形容梅雨的詩句要屬《千家詩》中，趙師秀《約客》一首最為著名：“黃梅時節家家雨，青草池塘處處蛙。有約不來過夜半，閒敲棋子落燈花。”
根據《長江中下游氣候》一書中有關入梅日期的統計：一般武漢是在6月16日、安徽安慶6月15日、南京和上海是6月17日。在湖南、江西、浙江大部，梅雨一般比長江流域來得早幾天。但降水日數很少的年份也出現過，氣象學上把這段時期沒有連續性降水的情況，稱為空梅。梅雨之後是長江中下游的.伏旱期，如果空梅，這一地區將有可能出現嚴重的夏旱。
芒種期間，華南汛期雖說處在晚期，依然會有大暴雨。正常情況，一般先進入梅雨期的是湖南、江西中部、浙江南部地區，入梅後如同華南一樣，該地區的主汛期開始，時有暴雨發生，山區地區需要警惕局地大暴雨引發的山洪、泥石流等次生災害。還有城市排除積水、農田排澇和搶救遇難群眾，都會列如應急預案之中。
歷史上1954、1991和1998年，梅雨期間的暴雨都引發了全流域性的特大洪水。根據國家防汛抗旱總指揮部辦公室今年5月釋出的洪澇災害統計，1998年因洪水死亡4150人，損失人民幣2550億元。當然這種情況的形成，一定是冷暖空氣勢力都較強，勢均力敵所致。
另外，西南地區從6月份也開始進入了一年中的多雨季節。此時，西南西部的高原地區冰雹天氣開始增多。
在此期間，除了青藏高原和黑龍江最北部的一些地區，還沒有真正進入夏季以外，大部分地區的人們，一般來說都能夠體驗到夏天的炎熱。位於黑龍江北部的嫩江，在1971～2000年30年間，最熱的一天37.1℃，就出現在芒種期間。
6月份，無論是南方還是北方，都有出現35℃以上高溫天氣的可能，黃淮地區、西北地區東部可能出現40℃以上的高溫天氣，但一般不是持續性的高溫。
在華南的臺灣、海南、福建、兩廣等地，6月的平均氣溫都在28℃左右，如果是在雷雨之前，空氣溼度大，確實是又悶又熱，有時需要向公眾釋出高溫預報，提醒人們預防中暑、空調病和急性腸胃炎。
