由於股權轉讓是一項較為複雜的法律行為，涉及的法律關係多，為了避免轉讓方與受讓方出現不必要的糾紛，一般都需要簽署書面的股權轉讓合同，以明確雙方的權利義務，因此股權轉讓合同在股權轉讓中具有極其重要的意義。下面由小編為大家整理的股權轉讓合同涉稅風險分析，歡迎大家閱讀瀏覽。
(一)自然人股東轉讓股權合同中的涉稅風險分析
自然人轉讓股權合同存在涉稅風險主要體現兩方面：
一方面是個人轉讓股權的法律手續不符合稅收法律規定。在實踐中總是存在一種現象：轉讓方和受讓方私自簽訂平價或折價的股權轉讓協議，不通過當地的稅務當局，而直接通過社會關係在當地的工商部門辦理工商變更登記手續。這是不符合稅法規定的，將受到稅務當局的稽查和處罰風險。另一方面是股權轉讓協議中的轉讓價格往往不符合獨立交易原則，即不符合稅收法律規定的折價或平價條件，而少申報繳納個人所得稅。根據《股權轉讓所得個人所得稅管理辦法(試行)》(國家稅務總局2014年公告第47號)第十二條 符合下列情形之一，視為股權轉讓收入明顯偏低：
(1)申報的股權轉讓收入低於股權對應的.淨資產份額的。其中，被投資企業擁有土地使用權、房屋、房地產企業未銷售房產、智慧財產權、探礦權、採礦權、股權等資產的，申報的股權轉讓收入低於股權對應的淨資產公允價值份額的;
(2)申報的股權轉讓收入低於初始投資成本或低於取得該股權所支付的價款及相關稅費的;
(3)申報的股權轉讓收入低於相同或類似條件下同一企業同一股東或其他股東股權轉讓收入的;
(4)申報的股權轉讓收入低於相同或類似條件下同類行業的企業股權轉讓收入的;
(5)不具合理性的無償讓渡股權或股份;
(6)主管稅務機關認定的其他情形。
案例分析
某自然人股東轉讓股權的涉稅分析
(1)案情介紹
王女士以現金100萬元創辦一家企業，經營三年後，王女士與李先生簽訂股權轉讓協議，協議約定：“王女士以90萬元的價格低於成本價將100%股權轉讓給李先生。”截止轉讓前，被轉讓企業的所有者權益為150萬元，其中註冊資本為100萬元，未分配利潤和盈餘公積為50萬元。請進行涉稅分析?
(2)涉稅分析
稅務機關認為該項股權轉讓計稅依據明顯偏低且無正當理由，對股權轉讓的計稅依據進行核定，核定依據按照所有者權益150萬元計算。因此，該項股權轉讓的財產轉讓所得為：150萬-100萬=50萬。應繳納個人所得稅50萬×20%=10萬元。假設本案例的轉讓價格為120萬元，如果按照申報的轉讓價格120萬元計算，應繳納(120-100)×20%=4(萬元)個人所得稅，而稅務機關認為低於對應淨資產份額，核定計稅依據150萬元，即也應繳納個人所得稅10萬元。本案例說明了兩種情況，一種是申報價格低於了初始投資成本，第二種是雖然高於初始投資成本，但是低於對應的淨資產份額。
(二)法人轉讓股權合同存在的涉稅風險分析
《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》(中華人民共和國國務院令》第512號)第八十三條 企業所得稅法第二十六條第(二)項所稱符合條件的居民企業之間的股息、紅利等權益性投資收益，是指居民企業直接投資於其他居民企業取得的投資收益。企業所得稅法第二十六條第(二)項和第(三)項所稱股息、紅利等權益性投資收益，不包括連續持有居民企業公開發行並上市流通的股票不足12個月取得的投資收益。 國稅函[2010]79號明確轉讓股權收入扣除為取得該股權所發生的成本後，為股權轉讓所得。企業在計算股權轉讓所得時，不得扣除被投資企業未分配利潤等股東留存收益中按該項股權所可能分配的金額。《國家稅務總局關於企業所得稅核定徵收有關問題的公告》(國家稅務總局公告2012年第27號)第二條規定：“依法按核定應稅所得率方式核定徵收企業所得稅的企業，取得的轉讓股權(股票)收入等轉讓財產收入，應全額計入應稅收入額，按照主營專案(業務)確定適用的應稅所得率計算徵稅;若主營專案(業務)發生變化，應在當年彙算清繳時，按照變化後的主營專案(業務)重新確定適用的應稅所得率計算徵稅。
基於以上稅收法律的規定，法人轉讓股權協議中的稅收風險主要體現在兩點：
1、被投資企業有多年累積的未分配利潤和盈餘公積時，法人轉讓股權的轉讓價格中含有被投資企業多年累積的未分配利潤和盈餘公積與轉讓方股東所佔股權比例的乘積部分，而使股權轉讓價格是溢價轉讓從而使轉讓方股東多繳納企業所得稅。
2、核定應稅所得率方式核定徵收企業所得稅的企業，發生股權(股票)轉讓時，按照轉讓收入扣除股權(股票)投資成本作為應稅收入額，使企業少繳納料企業所得稅。
根據以上涉稅風險分析，法人轉讓股權合同中的涉稅風險應採取以下控制措施：
1、 如果股東是企業或法人，在發生轉讓股權時，為了實現少繳納企業所得稅，則可以先將留存收益進行分配，降低淨資產，再轉讓股權，從而降低轉讓所得，減少企業所得稅。
2、依法按核定應稅所得率方式核定徵收企業所得稅的企業，取得的轉讓股權(股票)收入等轉讓財產收入，應全額計入應稅收入額，按照主營專案(業務)確定適用的應稅所得率計算徵稅。
