在電子商務中採用支付工具是商家必須考慮的問題，但不管是採用哪一種付款工具，都必須具備安全性高、處理成本低、且廣為全球金融市場所接受，而安全性高不高是成功電子商務活動的關鍵體現。在安全性上存在一定顧慮的就成了，企業本身、消費者、金融第三方都得考慮和麵對的問題。這三方在安全性方面都注重什麼方面，存在什麼問題呢?
對於企業而言，安全性更重要，企業是負責提供商品及服務的，而第三方的支付平臺也融合在企業網頁中，消費者是通過企業來進入電子支付的，那麼企業本身在安全性上面就考慮的更多，像電子支付功能的是否完善，電子支付工具是否安全，交易記錄、交易報告、客戶資訊、產品資訊是否安全，都成為了企業擔心的方方面面。
對於消費者而言，如果自身安全資訊被盜，就將損失的.錢及資訊，在消費過程中是否能得到安全保障，能不是順利完成交易，如遇故障是不是能後續處理等等。
對於第三方支付平臺而方，由於本身面臨著在法律地位上的特殊性，所以安全性就更為擔心了，作為第三方支付平臺，它代理著企業與消費者的資金，如果安全性出了問題，這雙方都將平臺至於頂上，能不能有一種安全的平臺進行操作，平臺是否可以穩健的執行，是應當考慮的問題。
儘管目前電子支付還存在很多像安全性和信譽度的問題，但作為電子商務的中心環節，電子支付系統的發展趨勢還是不可阻擋的，這就要求電子支付系統最好能在一個較好的法律環境和比較完善的安全性前提下執行，這樣的才能發揮它應有的作用。
