中國海洋大學重點專業
國家品牌專業7個：化學、生物科學、水產養殖學、海洋資源開發技術、環境工程、港口航道與海岸工程、法學、會計學。
國家重點專業2個：海洋科學、地質學。
中國海洋大學特色專業
海洋環境
學院是中國海洋大學最具海洋特色的學院，也是歷史最悠久的學院之一。學院包括國家級重點學科海洋科學和環境科學，山東省重點學科——大氣科學。其中海洋學本科專業是“國家理科基礎科學研究和教學人才培養基地”首批15個基地之一。院系的'創立者赫崇本教授是我國海洋科學與教育事業的奠基者之一，也可謂是該學院的“金子招牌”，曾擔任過國家科委海洋組副組長，國家海洋局顧問等職務，為我國的海洋事業作出了巨大的貢獻。
生物科學
專業也是海洋大學設立最早、久負盛名的專業之一，有著悠久的歷史和輝煌的成就，曾為我國培養了一大批知名的生物學家，屬國家級特色專業。生物系是山東省重點學科和國家生物學一級學科的重要組成部分。聯合國教科文組織中國海洋生物工程中心也設在本系。足見其雄厚的學科實力。
軍事海洋學
是中國海洋大學2002年新開設的專業，是海洋學與軍事學相結合的新興學科。它以軍事作戰需求為牽引，以海洋學的基本知識和研究方法為基礎，研究如何利用海洋要素的變化規律為軍事作戰服務的學科。研究重點是海洋聲學，包括海洋聲學特性、聲學器材;深海研究，包括深海底地質地貌、海底工程和水下施工技術;深潛技術，包括深淺裝置、潛水醫學和潛水技術等。以及反潛戰環境預報。
