海南省共有2所三本大學參與了2016海南三本大學排名，其中排名第一的.是三亞學院，排名第二的是海口經濟學院，以下是海南三本大學排名2016具體榜單：
| 海南三本大學排名 | 全國排名 | 學校名稱 | 學校型別 |
| 1 | 5（民辦大學排名） | 三亞學院 | 綜合 |
| 2 | 海口經濟學院 | 財經 |
說明：海南三本大學排名2016資料來源於中國校友會研究團隊，該團隊連續25年做中國大學排名，主要評價指標有教學水平、培養質量、學科建設、科研成果、傑出師資、創新基地、科研專案、辦學層次、社會聲譽和國際化水平等，在大學排名領域還比較權威。
一、三亞學院
三亞學院是國家教育部批准成立的普通本科院校，由吉利集團、銘泰集團董事長李書福先生出資建設，是國家教育部批准成立的獨立設定的民辦普通本科院校，是由吉利控股集團李書福先生資助的、中國熱帶濱海城市第一所全日制普通本科高等院校。學校總佔地面積3000畝，建築總面積50多萬平方米，下設 14個教學學院和1個教學部，開設了58個本科專業(含專業方向)，覆蓋法學、文學、經濟學、管理學、工學、理學、農學、教育學、藝術學等9個學科門類。全日制在校生為18500人。
二、海口經濟學院
海口經濟學院是一所以經濟、管理類專業為主，文、理、工、藝術等並存的多科性全日制普通本科院校。學校創辦於1974年，2008年3月經教育部批准升格為本科院校。
截至2012年9月6日，學校佔地1800畝，建築面積60多萬平方米。教學儀器裝置總值約9000萬元。圖書館大樓建築面積達4萬平米、閱覽座位4000餘個、館藏圖書114.5萬冊;擁有可容納2800多人的大劇場和現代化的音樂廳與演播廳;體育設施齊全：有兩個大型田徑運動場，一個綜合體育訓練館，一個室內游泳館及多個燈光籃球場、排球場與網球場。
