臺灣清華大學院系設定
電機資訊學院
電機工程學系暨研究所
資訊工程學系暨研究所
電子工程研究所
通訊工程研究所
光電工程研究所
資訊系統與應用研究所
理學院
數學系暨研究所
物理學系暨研究所
化學系暨研究所
統計學研究所
工學院
動力機械工程學系暨研究所
化學工程學系暨研究所
材料科學與工程學系暨研究所
工業工程與工程管理學系暨研究所
微機電系統工程研究所
生命科學院
生命科學系
生物科技研究所
分子醫學研究所
分子與細胞生物研究所
生物資訊與結構生物研究所
人文社會學院
人文社會學系
中國文學系暨研究所
外國語文學系暨研究所
經濟學系暨研究所
歷史研究所
語言學研究所
人類學研究所
社會學研究所
哲學研究所
臺灣文學研究所
原子科學院
原子科學系暨研究所(2006年起改名為“生醫工程與環境科學系”)
工程與系統科學系暨研究所
科技管理學院
計量財務金融學系
科技管理研究所
科技法律研究所
研究中心
原子科學技術發展中心
材料科學中心
電腦與通訊科技研發中心
生物工程中心
科學儀器中心
貴重儀器中心
國家理論科學中心
積體電路設計技術研發中心
科技與社會研究中心
奈米與微系統研究中心
光電研究中心
清大/工研院聯合研究中心
當代中國研究中心
高等教育研究中心
能源與環境研究中心
腦科學研究中心
