硬碟主引導記錄所在的扇區也是病毒重點攻擊的地方，通過破壞主引導扇區中的DPT(分割槽表)，即可輕易地損毀硬碟分割槽資訊。分割槽表的損壞通常來說不是物理損壞，而是分割槽資料被破壞。因此，通常情況下，可以用軟體來修復。
通常情況下，硬碟分割槽之後，備份一份分割槽表至軟盤、光碟或者USB盤上是極為明智的。這個方面，國內著名的防毒軟體瑞星提供了完整的解決方案。另外，對於沒有備份分割槽表的硬碟，也提供了相應的修復方法，不過成功率相對較低。
另外，中文磁碟工具DiskMan在這方面也是行家裡手。重建分割槽表作為它的一個“殺手鐗”功能，非常適合用來修復分割槽表損壞。
對於硬碟分割槽表被分割槽調整軟體(或病毒)嚴重破壞，引起硬碟和系統癱瘓，DiskMan可通過未被破壞的分割槽引導記錄資訊重新建立分割槽表。在選單的工具欄中選擇“重建分割槽表”，DiskMan即開始搜尋並重建分割槽。DiskMan將首先搜尋0柱面0磁頭從2扇區開始的`隱含扇區，尋找被病毒挪動過的分割槽表。接下來搜尋每個磁頭的第一個扇區。搜尋過程可以採用“自動”或“互動”兩種方式進行。自動方式保留髮現的每一個分割槽，適用於大多數情況。互動方式對發現的每一個分割槽都給出提示，由使用者選擇是否保留。當自動方式重建的分割槽表不正確時，可以採用互動方式重新搜尋。
但是，需要注意的是，重建分割槽表功能不能做到百分之百的修復分割槽表，除非你以前曾經備份過分割槽表，然後通過還原以前備份的分割槽表來修復分割槽表損壞。因此可見，平時備份一份分割槽表是多麼的必要!
