比較合理的連結結構通常是樹形結構，如圖4-7所示。
圖4-7樹形網站連結結構示意圖
H為網站首頁，Cl和C2是分類首頁，Pl、P2是分類Cl下產品頁面，P3、P4是分類C2下產品。其中的連結關係如下：
首頁連結向所有分類首頁。
首頁一般不直接連結向產品頁，除了幾個需要特殊推廣的產品，如P3。
所有分類首頁連向其他分類首頁，一般以網站導航形式體現。
分類首頁都連結回網站首頁。
分類首頁連結向本分類下的產品頁。
分類首頁一般不連結向其他分類的產品頁。
產品頁都連結向網站首頁，一般以網站導航形式體現。
產品頁連結向所有分類首頁，一般以網站導航形式體現。
產品頁可以連結向同一個分類的其他產品頁。
產品頁一般不連結向其他分類的產品頁。
在某些情況下，產品頁可以用適當的關鍵詞連結向其他分類的產品頁，如P2連結向P3。
從圖示和說明可以看到，這些連結會很自然地形成一個樹形的網路圖。這種連結網路可以與物理結構重合，也可以不一樣，比如扁平式的物理結構網站完全可以通過連結形成連結上的樹形結構。
當然實際網站的`連結結構要複雜得多，一級分類不可能只有兩個，下面還可能有二級、三級分類，末級分類可能有很多個翻頁，還可能有各種排序頁面等。但網站連結基本形式大體相同。
對搜尋引擎來說更重要的是連結結構，而不是物理結構。不少人有誤解'認為物理結構比較深的頁面不容易被搜尋引擎收錄。一般物理目錄結構比較深的URL，是不容易被搜尋引擎蜘蛛抓取的。如果這個頁面在網站首頁上有一個連結，對搜尋引擎來說它就是一個僅次於首頁的連結結構意義上的二級頁面。
